اولین فرمان سید علیمحمد و آغاز درگیریها سید علیمحمد پس از ادعای بابیت ظاهرا عازم مکه شده و پس از بازگشت از مکه به بوشهر وارد گردید و اولین فرمان خود را صادر نمود چنانچه در تلخیص تاریخ نبیل زرندی آمده است: باب در مراجعت از مکه در بوشهر چند روزی اقامت کرد، دستوراتی به قدوس (محمد علی بابکی یکی از گروندگان باب) در رسالهای به نام خصایل سبعه داد که آن را به شیراز ببرد که از جمله دستورات این بود: (بر اهل ایمان واجب است در اذان نماز جمعه جمله اشهد ان علیا قبل نبیل – که به حساب ابجد نبیل 92 است و محمد هم 92 – باب بقیة الله را اضافه کنند(… و آیتی نیز در کواکب الدریه مینویسد: «باب نزد خانه کعبه داعیه خود را علنی نموده بدین نغمه بدیعتا تغنی نمود: «انا القائم الذی تنتظرون» من همان قائم هستم که انتظار او را میکشید.» و در کتاب ظهور الحق مینویسد: «سید باب به عبدالخالق یزدی مینویسد: «انا القائم الذی کنتم بظهوره تنتظرون» در اثر این ادعاها و ظاهر کردن چنین کلماتی سید علیمحمد تحت تعقیب حکومت بوشهر قرار گرفت.